VarSeq
VarSeqは直感的で統合された三次解析用ソフトウェアソリューションです。VarSeqを使えばワークフローを自動化し、遺伝子パネル、エクソーム、全ゲノムの変異を解析できます。私たちのソフトウェアでゲノムデータの理解がこれまでになく簡単になりました。
VarSeq 紹介
とは何か VarSeq?
VarSeqは直感的で統合された三次解析用ソフトウェアソリューションです。VarSeqを使えばワークフローを自動化し、遺伝子パネル、エクソーム、全ゲノムの変異を解析できます。私たちのソフトウェアでゲノムデータの理解がこれまでになく簡単になりました。\n\nVarSeqは強力なフィルタリングと注釈エンジンを提供し、大規模な変異データセットを効率的に絞り込みます。フィルタの連鎖を使い、関心のある変異を迅速に特定可能。解析に適したパラメータを決定後、フィルタ状態を保存して別のデータセットにも同じ解析を適用できます。同じ自動化ワークフローを各サンプルバッチに使用できるため、高スループット環境に理想的です。リアルタイムフィルタリングにより、研究室で使用する特定の遺伝子パネルに合わせて解析ワークフローを迅速に試作・調整可能。適切なフィルタセットが見つかれば、将来のシーケンス出力に再入力なしで適用可能。\n\nデータインポート後、事前設定に基づき注釈が自動適用されます。解析中いつでも追加注釈を追加可能。Golden Helixチームは多くの公開データベースをキュレーションし、四半期ごとに更新。解析で使用する注釈はデータと共にローカルに保存され、明示的な要求なしに変更されません。これにより安定したデータセットで解析が行われ、結果の再現性と将来の利用が保証されます。\n\nVarSeqは2種類のカバレッジ指標を提供。まず、各変異はその位置する領域のデータを表示。これにより疑わしい領域の変異をフラグ付けまたは除外でき、偽陽性防止に役立ちます。次に、BEDファイル内の各領域を検査可能。この解析モードは全ターゲット領域がシーケンスされたことを確認し、偽陰性防止に重要です。\n\nVarSeqにはSnpEffやVariant Effect Predictorに類似した機能が含まれます。各変異は重複するすべての転写産物にマッピングされ、位置情報（エクソン、イントロン、遺伝子間など）、配列オントロジー（フレームシフト、同義置換など）、HGVS表記（gドット、cドット、pドット）が提供されます。各変異について最も影響の大きい注釈または全変異-転写産物相互作用セットでフィルタリング可能。\n\nGenomeBrowseがVarSeqに組み込まれているため、アンプリコン全体のカバレッジを簡単に確認可能。BAMおよびBEDファイルをプロジェクトに追加し、パイルアップを直接検査。GenomeBrowseは上流のシーケンスパイプラインが正しく機能していることを確認するためのコンテキストを提供。\n\nデータをインポートし、ワークフローを選択して探索を開始。非常に簡単です！データのアップロード不要。複雑なパラメータ選択不要。難しいファイル変換不要。VarSeqは解析プロセスを本質にまで簡素化し、作業の妨げとなる障害をすべて取り除きます。
使い方 VarSeq?
使用方法はありません。
選ぶ理由 VarSeq?
強力で使いやすいソフトウェアで遺伝子変異を迅速かつ正確に解析したい場合に選んでください。自動化されたワークフローと信頼性の高いデータフィルタリングが必要な研究室に最適です。
VarSeq 特徴
特徴
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価格
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VarSeq タグ
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